Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS9Q3SYG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms