Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT71Q3SY84 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms