Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP24-1Q3LI83 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms