Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC57Q2TAC2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC57Q2TAC2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms