Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms