Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms