Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MICAQ29983 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MICAQ29983 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MICAQ29983 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MICAQ29983 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MICAQ29983 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MICAQ29983 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MICAQ29983 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MICAQ29983 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICAQ29983 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MICAQ29983 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms