Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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