Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLPPQ16740 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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