Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms