Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms