Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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ZNF239Q16600 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF239Q16600 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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