Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKN1Q16512 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN1Q16512 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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