Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6AP1Q15904 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms