Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPTX1Q15818 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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