Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKIV2LQ15477 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms