Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF1Q15361 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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