Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRRQ15256 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRRQ15256 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms