Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
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