Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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