Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME4Q14997 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME4Q14997 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME4Q14997 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME4Q14997 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME4Q14997 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME4Q14997 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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