Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIN2CQ14957 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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