Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN1Q14699 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN1Q14699 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
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RFTN1Q14699 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFTN1Q14699 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFTN1Q14699 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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