Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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