Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE4AQ14139 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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