Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBFBQ13951 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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