Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCINQ13939 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCINQ13939 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CCINQ13939 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CCINQ13939 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCINQ13939 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCINQ13939 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCINQ13939 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCINQ13939 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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