Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1CQ13936 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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