Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H2Q13888 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H2Q13888 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms