Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX3Q13761 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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