Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC1Q13547 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC1Q13547 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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