Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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