Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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