Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL28Q13084 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL28Q13084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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