Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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