Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXC1Q12948 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXC1Q12948 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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