Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMAN2Q12907 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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