Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 SRB8YCR081W 4284 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 STE6YKL209C 3873 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YPS6YIR039C 1614 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YDL050CYDL050C 372 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 OPI6YDL096C 327 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YEA4YEL004W 1029 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 ATG10YLL042C 504 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RPL6BYLR448W 531 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YMR141CYMR141C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 INO4YOL108C 456 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RRG7YOR305W 729 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 LTP1YPR073C 486 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 snR35snR35 204 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 ARL1YBR164C 552 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 CBP2YHL038C 1893 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 CDC40YDR364C 1368 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 ARP5YNL059C 2268 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 JIP5YPR169W 1479 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 DSF2YBR007C 2211 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 PNC1YGL037C 651 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RPS21BYJL136C 264 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YKR011CYKR011C 1062 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YOL114CYOL114C 609 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 GCY1YOR120W 939 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 MDM36YPR083W 1740 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 CBP6YBR120C 489 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 SRP68YPL243W 1800 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YNL011CYNL011C 1335 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 NDT80YHR124W 1884 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 TFC4YGR047C 3078 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 CIN8YEL061C 3003 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 UBC13YDR092W 462 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YGR115CYGR115C 780 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 AGE2YIL044C 897 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 APC9YLR102C 798 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 LIP2YLR239C 987 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 TPT1YOL102C 693 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YOL107WYOL107W 1029 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 PEX6YNL329C 3093 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 TPO5YKL174C 1857 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 VPS3YDR495C 3036 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 ESL1YIL151C 3357 nt3.21□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 RED1YLR263W 2484 nt3.21□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 YNR063WYNR063W 1824 nt3.21□□□□□ -1.89
SEC39Q12745 NOP56YLR197W 1515 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 FMN1YDR236C 657 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 VAB2YEL005C 849 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YKL115CYKL115C 393 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PIR1YKL164C 1026 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 NBP1YLR457C 960 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MSR1YHR091C 1932 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 UBP8YMR223W 1416 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 STP2YHR006W 1626 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 VAC14YLR386W 2643 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YDR203WYDR203W 318 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YPR1YDR368W 939 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YGR017WYGR017W 894 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 VMA10YHR039C-A 345 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YHR180WYHR180W 492 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 DAL2YIR029W 1032 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 ENV10YLR065C 546 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RFC3YNL290W 1023 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 TIM12YBR091C 330 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RAX2YLR084C 3663 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RAD18YCR066W 1464 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 APM3YBR288C 1452 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 JJJ1YNL227C 1773 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 SYO1YDL063C 1863 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 CDC37YDR168W 1521 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 POL4YCR014C 1749 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 TAF2YCR042C 4224 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 GCD6YDR211W 2139 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 SPP382YLR424W 2127 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 DIG2YDR480W 972 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PEF1YGR058W 1008 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 CAP1YKL007W 807 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YKL069WYKL069W 543 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RCN1YKL159C 636 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 YPT52YKR014C 705 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PFY1YOR122C 381 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RPC40YPR110C 1008 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RXT2YBR095C 1293 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 POP7YBR167C 423 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MPS1YDL028C 2295 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 PMR1YGL167C 2853 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 MSH2YOL090W 2895 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 RIF1YBR275C 5751 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC39Q12745 BUD4YJR092W 4344 nt3.18□□□□□ -1.9
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