Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YNL338WYNL338W 159 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 PPG1YNR032W 1107 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 CTR86YCR054C 1692 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 QDR1YIL120W 1692 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MNN1YER001W 2289 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MIC19YFR011C 513 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 TIR2YOR010C 756 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 FSH3YOR280C 801 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YRR1YOR162C 2433 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MPH3YJR160C 1809 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RNH70YGR276C 1662 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 DSF2YBR007C 2211 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 HIS4YCL030C 2400 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RAD52YML032C 1416 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YPS5YGL259W 498 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 TPA1YER049W 1935 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MCH4YOL119C 1506 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RIM21YNL294C 1602 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 DSN1YIR010W 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MED1YPR070W 1701 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RPN6YDL097C 1305 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 SED4YCR067C 3198 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MAL33YBR297W 1407 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YDL228CYDL228C 642 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 WIP1YDR374W-A 270 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YFL063WYFL063W 456 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YFL064CYFL064C 525 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YLR076CYLR076C 423 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 LDB7YBL006C 543 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RPL9BYNL067W 576 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RIM13YMR154C 2184 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 CAF4YKR036C 1932 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 DIE2YGR227W 1578 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 SMP3YOR149C 1551 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 NTH2YBR001C 2343 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 ALD3YMR169C 1521 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 HSP30YCR021C 999 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YET3YDL072C 612 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YJL202CYJL202C 348 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 PEX17YNL214W 600 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 UBC11YOR339C 471 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 YPL062WYPL062W 405 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 RPC40YPR110C 1008 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 MMP1YLL061W 1752 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 UBA2YDR390C 1911 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 NIC96YFR002W 2520 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 BCP1YDR361C 852 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 SPR6YER115C 576 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 PAC1YOR269W 1485 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 PEX30YLR324W 1572 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 STE7YDL159W 1548 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 ASK10YGR097W 3441 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-DR3Q12441 IMA1YGR287C 1770 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YGR176WYGR176W 348 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 TRX2YGR209C 315 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 HHF2YNL030W 312 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YBR178WYBR178W 375 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 MDM36YPR083W 1740 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 SIP1YDR422C 2448 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 STV1YMR054W 2673 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YJL132WYJL132W 2253 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 BCH2YKR027W 2298 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YDR526CYDR526C 471 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 MSL1YIR009W 336 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPA34YJL148W 702 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 CNB1YKL190W 528 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YMR295CYMR295C 594 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 IST1YNL265C 897 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 HSP26YBR072W 645 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 MKT1YNL085W 2493 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 STI1YOR027W 1770 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 NHA1YLR138W 2958 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YJL206CYJL206C 2277 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 CBF5YLR175W 1452 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 SNF12YNR023W 1701 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 MCM2YBL023C 2607 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 SAP155YFR040W 3009 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YFR035CYFR035C 345 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPL11BYGR085C 525 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPS4BYHR203C 786 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 APQ12YIL040W 417 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 PAM16YJL104W 450 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YLR302CYLR302C 363 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 ATX1YNL259C 222 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YOR385WYOR385W 873 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPL11AYPR102C 525 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YOL019WYOL019W 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 DBF20YPR111W 1695 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 DIT2YDR402C 1470 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 ADE4YMR300C 1533 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 SIT4YDL047W 936 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 GPI8YDR331W 1236 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 LCL3YGL085W 825 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 OM45YIL136W 1182 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 GDT1YBR187W 843 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 IMD4YML056C 1575 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 UTP13YLR222C 2454 nt4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms