Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 MFA1YDR461W 111 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YJL028WYJL028W 336 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 ATX1YNL259C 222 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YPL062WYPL062W 405 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SSO1YPL232W 873 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SEC2YNL272C 2280 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 GYP6YJL044C 1377 nt6.02□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RRI2YOL117W 1938 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 CDC6YJL194W 1542 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 PSF1YDR013W 627 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YDR537CYDR537C 606 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 USE1YGL098W 738 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 GPG1YGL121C 381 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 GAT4YIR013C 366 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RAD27YKL113C 1149 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 HXT15YDL245C 1704 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 HXT16YJR158W 1704 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YMR102CYMR102C 2505 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YFL042CYFL042C 2025 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 GUA1YMR217W 1578 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 PIF1YML061C 2580 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 MGS1YNL218W 1764 nt6.01□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SAC6YDR129C 1929 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YFR054CYFR054C 579 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YGR190CYGR190C 366 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 NHP6BYBR089C-A 300 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 POF1YCL047C 777 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 GAD1YMR250W 1758 nt6□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 FUI1YBL042C 1920 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 IFM1YOL023W 2031 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RIM4YHL024W 2142 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 TRK2YKR050W 2670 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RSC6YCR052W 1452 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RPL7AYGL076C 735 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 TVP18YMR071C 504 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RPL7BYPL198W 735 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 ARC40YBR234C 1155 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 FUS2YMR232W 2034 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 VPS5YOR069W 2028 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 BI4Q0120 1917 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 MSM1YGR171C 1728 nt5.99□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 CCZ1YBR131W 2115 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 TMN2YDR107C 2019 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YBP2YGL060W 1926 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 LST4YKL176C 2487 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SUR2YDR297W 1050 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 PAU17YLL025W 375 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 IRC23YOR044W 474 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SCT1YBL011W 2280 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SKN7YHR206W 1869 nt5.98□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 IMD3YLR432W 1572 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 VAC8YEL013W 1737 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 HOM2YDR158W 1098 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 SBH1YER087C-B 249 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 COX17YLL009C 210 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 TMA10YLR327C 261 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 RPS16AYMR143W 432 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 YBR242WYBR242W 717 nt5.97□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 TRE1YPL176C 2352 nt5.96□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 ATP1YBL099W 1638 nt5.96□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 MET7YOR241W 1647 nt5.96□□□□□ -1.45
NCR1Q12200 MKC7YDR144C 1791 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 PCK1YKR097W 1650 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 GOS1YHL031C 672 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 YKE2YLR200W 345 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 TSC3YBR058C-A 243 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 LTP1YPR073C 486 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 HSP104YLL026W 2727 nt5.96□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 APP1YNL094W 1764 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 SNZ3YFL059W 897 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 TRX2YGR209C 315 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 NNF1YJR112W 606 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 SNZ2YNL333W 897 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 YOR318CYOR318C 306 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 ERI1YPL096C-A 207 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 LRE1YCL051W 1752 nt5.95□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 TDA11YHR159W 1515 nt5.94□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 TPO5YKL174C 1857 nt5.94□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 MMP1YLL061W 1752 nt5.94□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 TAR1YLR154W-C 375 nt5.94□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 NTH1YDR001C 2256 nt5.94□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 STI1YOR027W 1770 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 YFL034WYFL034W 3222 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 VPS55YJR044C 423 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 YBL073WYBL073W 312 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 MTL1YGR023W 1656 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 ASN1YPR145W 1719 nt5.93□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 CRZ1YNL027W 2037 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 SSK22YCR073C 3996 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 PIR1YKL164C 1026 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 RPL15AYLR029C 615 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 RPS15YOL040C 429 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 MSN2YMR037C 2115 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 NOP53YPL146C 1368 nt5.92□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 THS1YIL078W 2205 nt5.91□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 GPT2YKR067W 2232 nt5.91□□□□□ -1.46
NCR1Q12200 snR72snR72 98 nt5.91□□□□□ -1.46
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