Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 COS2YBR302C 1140 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 GSH2YOL049W 1476 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 MSM1YGR171C 1728 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 PHO2YDL106C 1680 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 MED2YDL005C 1296 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 VPS35YJL154C 2835 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YJL113WYJL113W 4647 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 MIG1YGL035C 1515 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 FIN1YDR130C 876 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 HMT1YBR034C 1047 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 PAN2YGL094C 3348 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YOL057WYOL057W 2136 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 GNT1YOR320C 1476 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YHI9YHR029C 885 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 GLG2YJL137C 1143 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 NDL1YLR254C 570 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 FIG4YNL325C 2640 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 UBP8YMR223W 1416 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 NOP14YDL148C 2433 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 NNT1YLR285W 786 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 HPA2YPR193C 471 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-BRQ12193 UBP3YER151C 2739 nt2.28□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 CSH1YBR161W 1131 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 SWA2YDR320C 2007 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 TRA1YHR099W 11235 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YJL015CYJL015C 285 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 OST1YJL002C 1431 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 DUF1YOL087C 3351 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 SMX2YFL017W-A 234 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 HHF2YNL030W 312 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 BUD3YCL014W 4911 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YCR050CYCR050C 309 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YJR056CYJR056C 711 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YBL096CYBL096C 309 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YBP1YBR216C 2025 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YLR345WYLR345W 1530 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 CCM1YGR150C 2595 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 EPO1YMR124W 2832 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 SIR3YLR442C 2937 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 APM3YBR288C 1452 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YGR293CYGR293C 462 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YML003WYML003W 873 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 MRPL33YMR286W 261 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 BNI1YNL271C 5862 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 GPP2YER062C 753 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 YPR177CYPR177C 372 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 VBA4YDR119W 2307 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 TMA64YDR117C 1698 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 PEX21YGR239C 867 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 snR3snR3 194 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 CTK2YJL006C 972 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 ISF1YMR081C 1017 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YER138CYER138C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YER160CYER160C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YJR027WYJR027W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YML039WYML039W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YML045WYML045W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YMR050CYMR050C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 VPS3YDR495C 3036 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YPR089WYPR089W 2667 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 RIM13YMR154C 2184 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 TAM41YGR046W 1158 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YIL102CYIL102C 306 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 ERP1YAR002C-A 660 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YLR462WYLR462W 609 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 CSF1YLR087C 8877 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 AGE1YDR524C 1449 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 ORC2YBR060C 1863 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 PKR1YMR123W 369 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 TAF14YPL129W 735 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 PSY3YLR376C 729 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 TOP2YNL088W 4287 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 SYH1YPL105C 2550 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 SMY2YBR172C 2223 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 ATP17YDR377W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 SPO75YLL005C 2607 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 FMP48YGR052W 1110 nt2.16□□□□□ -2.06
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