Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 SMC6YLR383W 3345 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 HAA1YPR008W 2085 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 WHI3YNL197C 1986 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 PDR11YIL013C 4236 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 HMO1YDR174W 741 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 YDR535CYDR535C 501 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 SMX2YFL017W-A 234 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 SOL3YHR163W 750 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 YNL043CYNL043C 321 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 PRM4YPL156C 855 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 PIN3YPR154W 648 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 ENP2YGR145W 2124 nt2.78□□□□□ -1.96
TY3A-GQ12173 CBP2YHL038C 1893 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RIM1YCR028C-A 408 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YGR114CYGR114C 390 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 TRM112YNR046W 408 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YCL023CYCL023C 348 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SSQ1YLR369W 1974 nt2.77□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 CET1YPL228W 1650 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RRP14YKL082C 1305 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 NUM1YDR150W 8247 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 TSC13YDL015C 933 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 ADH4YGL256W 1149 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 TCD1YHR003C 1290 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 DCG1YIR030C 735 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 LSM8YJR022W 330 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 KTI11YBL071W-A 249 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YNL234WYNL234W 1281 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SEC7YDR170C 6030 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SWC4YGR002C 1431 nt2.76□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 PFF1YBR074W 2931 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 ARP8YOR141C 2646 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 ECM29YHL030W 5607 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YDL026WYDL026W 312 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SAY1YGR263C 1275 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 OMA1YKR087C 1038 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 TPT1YOL102C 693 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YOL114CYOL114C 609 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YGR067CYGR067C 2415 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 TOM1YDR457W 9807 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 PSP1YDR505C 2526 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SKT5YBL061C 2091 nt2.75□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 APC5YOR249C 2058 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 AAD16YFL057C 459 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 IRC14YOR135C 342 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 AVT5YBL089W 1380 nt2.74□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 AXL1YPR122W 3627 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SEM1YDR363W-A 270 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 BRR6YGL247W 594 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RBL2YOR265W 321 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 MSH4YFL003C 2637 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 URB2YJR041C 3525 nt2.73□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YCR015CYCR015C 954 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 SRB8YCR081W 4284 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RPL13AYDL082W 600 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YDL186WYDL186W 834 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RNH202YDR279W 1053 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 CDC55YGL190C 1581 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YIL161WYIL161W 708 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YIL174WYIL174W 228 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RPL17BYJL177W 555 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RPS22AYJL190C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 FIP1YJR093C 984 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 EBP2YKL172W 1284 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 THI80YOR143C 960 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 MCT1YOR221C 1083 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 AFT2YPL202C 1251 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 NFT1YKR103W 3657 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 PEX6YNL329C 3093 nt2.72□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 KIN82YCR091W 2163 nt2.71□□□□□ -1.97
TY3A-GQ12173 RPN4YDL020C 1596 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 PSK2YOL045W 3306 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YGL138CYGL138C 1038 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YGL159WYGL159W 1113 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 POP6YGR030C 477 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 MMF1YIL051C 438 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 RPA12YJR063W 378 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YLL047WYLL047W 384 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 RSA1YPL193W 1146 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 TMN3YER113C 2121 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 KHA1YJL094C 2622 nt2.71□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YNL011CYNL011C 1335 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 SIR4YDR227W 4077 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 BOI1YBL085W 2943 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 VHR1YIL056W 1923 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 DUG2YBR281C 2637 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YDR537CYDR537C 606 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.7□□□□□ -1.98
TY3A-GQ12173 CPR7YJR032W 1182 nt2.7□□□□□ -1.98
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