Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFFO1Q0D2I5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms