Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD300CQ08708 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms