Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PUDPQ08623 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms