Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC18A2Q05940 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC18A2Q05940 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A2Q05940 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms