Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4A11Q02928 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4A11Q02928 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms