Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSC2Q02487 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC2Q02487 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms