Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A3Q01959 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms