Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDR2Q01850 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms